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  • PCR 芯片发 Biomark 文章的套路


    临床医生白天手术门诊弄得晕头转向,晚上还得看文献做实验想科研,怎么才能事半功倍呢,简单粗暴的文章套路是必须的了。对于手上攒着一堆临床样本的医生,最简单的套路就是 Biomark 研究了,今天我们就来谈谈利用 PCR 芯片发表 Biomark 相关的文章的套路。

    Biomark 的文章,下至无名小杂志,上至新英格兰,丰俭由人。

    简单的说,这个套路就是:

    从临床出发,在大样本中利用 PCR 芯片(可以是高通量测序或者表达谱芯片数据中挖掘的部分基因,也可以是某个通路或者特定基因)筛查验证在某种疾病状态/用药中显著升高或降低的分子→结合临床数据分析,确认该分子作为某疾病状态/用药疗效上的生物标志物。

    需要再加菜的,可以通过生物信息学/大量文献查询该生物标志物作用机制/信号通路→体外细胞验证→动物实验。
    这样一篇不错的文章就出来啦~完美!

    通常 Biomark 文章中需要涉及到的图表如下:

    1. 基线资料

     
    https://doi.org/10.1177/1177271919835570

    2. 表达差异

     
    https://doi.org/10.1177/1177271919835570


    https://doi.org/10.1186/s40364-019-0157-z


    https://doi.org/10.1177/1177271919835570

    3. ROC 分析


    https://doi.org/10.1186/s40364-019-0157-z

    4. AUCs, thresholds, sensitivity, and specificity


    https://doi.org/10.1177/1177271919835570

    5. 生存曲线(大幅提高 IF)


    https://doi.org/10.1182/blood-2016-09-742296



     




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